https://www.nature.com/articles/s41467-022-31994-x
由于可參考的關(guān)于 TcsH 的先前研究相對稀少,團隊在初期也遇到了不小的困難。其中一個(gè)難點(diǎn)就是合適的與毒素互作的靶向細胞的選擇。與其它 LCT 相比,TcsH 在很多常見(jiàn)細胞株上表現出來(lái)的毒性很弱。研究團隊意識到篩選合適細胞系的重要性,于是測試了大量的不同組織來(lái)源的細胞系,多數人源細胞系對 TcsH 都不敏感,但研究中也發(fā)現了兩株特定的細胞,人結腸癌細胞系 HT-29 和人結直腸癌細胞系 Caco-2,對 TcsH 高度敏感?;谶@一發(fā)現,團隊選取了 HT-29 細胞作為研究 TcsH 的模式細胞,并且為了提高成功率,選擇兩個(gè)不同來(lái)源的人源 sgRNA 文庫在 HT-29 細胞上構建敲除文庫。通過(guò) TcsH 壓力篩選,研究者們發(fā)現這兩個(gè)獨立的篩選系統同時(shí)富集了一系列共同的靶向基因,包括跨膜絲氨酸蛋白酶2(TMPRSS2 )及巖藻糖基化修飾相關(guān)基因 GMDS、SLC35C1、FUT4(圖1)。通過(guò)構建基因突變和回補細胞,研究者們證明這些基因對 TcsH 的細胞侵入起了重要作用。
圖1. CRISPR/Cas9介導的全基因組敲除篩選發(fā)現與TcsH作用相關(guān)的宿主基因
TMPRSS2 由于廣泛參與了包括流感、SARS、MERS 等在內的多種病毒的細胞入侵而“臭名昭著(zhù)”。TMPRSS2 參與病毒入侵的方式是通過(guò)其絲氨酸蛋白酶活性激活病毒的刺突蛋白,從而促進(jìn)膜融合。有意思的是,TMPRSS2 的絲氨酸蛋白酶活性與其介導 TcsH 入侵完全無(wú)關(guān)(圖2)。另一方面,TMPRSS2 可以特異性地與 TcsH 進(jìn)行結合,親和力高達0.13 nM。說(shuō)明與“助攻”病毒感染的模式不同,TMPRSS2 是作為直接的蛋白受體協(xié)助毒素 TcsH 入侵靶向細胞的。
圖2. TMPRSS2 的絲氨酸蛋白酶活性缺失不影響介導TcsH入侵
值得一提的是,TMPRSS2 僅在少部分細胞上有較高水平表達,且其在細胞中的表達量與該細胞對 TcsH 的敏感性吻合,這也解釋了為何前期研究發(fā)現只有少數細胞株對 TcsH 是敏感的(圖3)。
圖3. TMPRSS2 高表達的細胞展現出對TcsH的高敏感性
另一方面,巖藻糖基化修飾廣泛存在于許多細胞表面,研究發(fā)現其與 TcsH 在細胞表面的結合密切相關(guān)。通過(guò)進(jìn)一步的生化和細胞學(xué)實(shí)驗,包括構建敲除后補回實(shí)驗、體外結合、競爭拮抗等,研究者們證明了 TMPRSS2 和巖藻糖化的作用是相互獨立的,兩者可競爭性地參與 TcsH 的細胞識別(圖4)。
圖4. TMPRSS2 和巖藻糖化多糖可作為T(mén)csH兩類(lèi)相互獨立的受體
最后,為進(jìn)一步探究 TMPRSS2 在生理和病理學(xué)上的意義,研究者們利用了一種 Tmprss2 全敲除的小鼠模型。腹腔注射毒素后發(fā)現,野生型(Tmprss2+/+)和雜合型(Tmprss2+/?)小鼠對TcsH的耐受性顯著(zhù)低于純合型(Tmprss2?/?)小鼠。由于腸道是索氏梭菌定植的重要部位之一,且已知部分腸道上皮細胞有較高的 TMPRSS2 表達。后續研究者們利用野生型和 Tmprss2 敲除小鼠構建腸道結扎模型,結果顯示 TcsH 處理后 Tmprss2 敲除小鼠結腸上皮損傷明顯小于野生型小鼠(圖5)。
圖5. 小鼠模型顯示TMPRSS2 是TcsH重要的病理相關(guān)受體
西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院的陶亮研究員為本文通訊作者;陶亮課題組的博士研究生李星星和賀柳晴為共同第一作者;其他合作作者包括西湖大學(xué)的李顏顏博士,博士后羅建華,博士研究生鄭洋鈴、周瑤、李丹陽(yáng),及科研助理張媛媛和潘振瑞;此外還感謝西湖大學(xué)生科院的章永登研究員在熒光顯微攝影方面提供的幫助。本課題受到國家自然科學(xué)基金、西湖實(shí)驗室(生命科學(xué)和生物醫學(xué)浙江省實(shí)驗室)及西湖教育基金會(huì )的資助;項目實(shí)施還得到了西湖大學(xué)生物醫學(xué)實(shí)驗技術(shù)中心和實(shí)驗動(dòng)物中心的支持和幫助。
西湖大學(xué)微生物宿主交互實(shí)驗室(實(shí)驗室主頁(yè)鏈接:https://tao.lab.westlake.edu.cn/)致力于研究微生物-宿主之間的相互作用方式和內在規律,尤其是從分子、生化、細胞、生信、結構等方面研究重要病原細菌及其致病因子對宿主的影響及作用機制。
西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院研究員陶亮近年來(lái)以通訊作者在 Cell、Cell Research、Nature Microbiology、Nature Communications、PLOS Pathogens 等學(xué)科主流期刊上發(fā)表多篇學(xué)術(shù)論文。實(shí)驗室招收博士研究生,且有多個(gè)博士后、科研助理崗位,方向包括且不限于分子微生物學(xué)、生物信息學(xué)和微生物組學(xué)、生物化學(xué)、免疫學(xué)、細胞生物學(xué)等,誠邀各方青年才俊加入、攜手共同成長(cháng)!
聯(lián)系方式:
taoliang@westlake.edu.cn